SMP Negeri 3 Brebes didirikan pada 1 Agustus 1956 dengan tujuan untuk memberikan pendidikan menengah pertama yang berkualitas bagi masyarakat Brebes dan sekitarnya. Sekolah ini telah berkembang pesat sejak pendiriannya, mengutamakan kualitas pendidikan serta pengembangan karakter siswa.
Seiring waktu, SMP Negeri 3 Brebes terus berupaya meningkatkan kualitas pengajaran dan fasilitasnya, serta menghasilkan lulusan yang tidak hanya cerdas secara akademis, tetapi juga berakhlak mulia. Pada tahun 1979, SMPN 3 Brebes mendapatkan status operasional yang semakin mendukung kelangsungan dan perkembangan sekolah ini.
Sekolah ini kini memiliki berbagai fasilitas pendukung pembelajaran, seperti ruang kelas yang nyaman, laboratorium, dan akses teknologi yang memadai, untuk mendukung proses pembelajaran yang inovatif. Dengan akreditasi A, SMP Negeri 3 Brebes terus berkomitmen untuk mencetak generasi muda yang siap menghadapi tantangan zaman.